区别职能不同。大惯栲狠疲理寺是最高审判机关，御史台为最高监察机关。
区别职责不同。大理寺负责审理朝廷文武百官犯罪以及京城徒刑以上案件，御史台职掌纠弹百官，大失窝蜜琶理寺、刑部的司法审判活动是否合法也在其监察范围之内。
区别职位，大理寺有23个职位，御史台有15个职位。
大理寺
相当于现代的最高法院，掌刑狱案件审理，长官名为大理寺卿，位九卿之列。秦汉为廷尉，北齐为大理寺，历代因之，明清时期与刑部、都察院并称为“三法司”。
清末新政改称为大理院，民国初年北洋军阀政府亦袭此名，为当时的最高审判机关。
御史台
东汉至元朝设置的中央监察机构。秦汉以御史负责监察事务。御史所居官署称御史府，又称兰台、宪台。
南朝梁陈、北魏魏齐时，称御史台。隋唐五代宋金元历代沿置。是中央行政监察机关，也是中央司法机关之一，负责纠察、弹劾官员、肃正纲纪。
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大理寺与刑部和御史台的关系
宋初刑部是最高司法机构之一，主管全国刑政，并审复大理寺所定大辟案件。
明清两代以刑部、都察院、大理寺为三法司。
若有重大案件，则由三法司会审，俗称“三堂会审”
刑部掌全国的刑罚政令，据《光绪会典》卷53载，其职掌是：“掌天下刑罚之政令，以赞上正万民。凡律例轻重之适，听断出入之孚，决宥缓速之宜，赃罚追贷之数，各司以达于部。
尚书侍郎率其属以定议，大事上之，小事则行，以肃邦犯。”这说明刑部受理全国刑事案件，主管刑罚及监狱等政令。
但若死刑案件，还须与大理寺、都察院共同审核。每年于八月间审办各省所报案件，名为“秋审”。
于霜降后审办京内案件，名为“朝审”。“秋审”、“朝审”均会同“九卿”（六部尚书及都察院左都御史、通政使、大理寺卿为“九卿”），詹事、科、道（六科给事中及十五道监察御史）各官共同审理。
凡涉及妇女旌表的案件须会同礼部同审；内外蒙古、热河都统等处有关少数民族的案件，会同理藩院审办。
但均由刑部主稿。凡宗室、觉罗氏犯罪，则由刑部、宗人府会同办理。宗室案由宗人府主稿，觉罗氏案由刑部主稿。
大理寺的职掌是：平反全国刑名案件，与刑部、都察院为“三法司”。凡须三法司会勘的重大案件（斩、绞罪案），先经刑部审明，送都察院参核，再送大理寺平允。
参考资料：