本次是《MOE脚本命令简介》最后一节,主要讲解MOE的一些实例。本体系其它节:MOE脚本命令简介_基本命令(1)MOE脚本命令简介_基本语法(2)MOE脚本命令简介_高级函数(3)
工具/原料
MOE
方法/步骤
1、案例1:有51个分子,我想要计算这51个分子间的相似性(使用分子指纹,tanimoto计算相似性)
2、案例2:moe分子对接时,有三个重要参数:Rescoring1【有['ASE','AffinitydG','AlphaHB','LondondG','None']5个可供选择值】、Refinement【有['Forcefield','GridMin','None']3个可供选择值】和Rescoring2【有['ASE','AffinitydG','AlphaHB','LondondG','None']5个可供选择值】;现在在分子对接时循环遍历所有参数组合的可能,请用脚本实现。
3、案例3:.sdf格式数据库中分子加电荷和能量最小化