口感不同：头水紫菜容易煮熟，且口感细嫩；可以取一小片紫菜放在口中咀嚼，头水紫菜口感爽滑，普通紫菜口感稍差。
味道不同：头水紫菜稍靠近就能闻到浓浓的紫菜香，普通紫菜的香味则较淡。
外形特征不同：头水紫菜叶片较窄，极其细腻，正面几乎看不出成片的紫菜，普通紫菜仔细看则可看出一叶一叶的紫菜；一般来讲越往后的紫菜，菜叶越宽。
营养不同：头水紫菜相对于普通紫菜来说，带有15%上下的矿物，有保持一切正常生理作用所必不可少的钾、钙、镁、磷、铁、锌、铜、锰等。在其中含硒和碘特别是在丰富多彩。初水紫菜还能够作为糖尿病日的果腹食品，因为它没有糖分。