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三代测序(全基因组denovo)

时间:2024-11-10 17:34:52

动植物基因组denovo测序基因Pacbio单分子实时测序技术,对动植物基因组进酚祯馄嫱行Pacbio测序及拼接组装(纯三代组装),较好解决了传统测序组装技术难以解决的高杂合度、高度重复区域斤舻浑趸、异常GC含量区域等诸多组装难题,极大提升大基因组的组装指标,重新定义ContigN50、ScaffoldN50指标——采用纯三代组装的基因组组装指标,是过去二代测序策略的10-20倍。

工具/原料

样本抽提DNA/RNA试剂盒

建库试剂盒

三代测序仪:PacbioRSⅡ或PacbioSequel

组装分析软件:Falcon

方法/步骤

1、技术路线

三代测序(全基因组denovo)

2、生物信息分析1.原始数据质量评估2.基因组组装3.基因组注释4.进化分析5.重测序或转录组联合分析

3、结果展示1饱终柯肢.软件使用FALCONHGAP(HierachicalGenomeAssmeblyProcess)2.版图展示图1.1所示,全基因组拼装后粲崛纫鳍预测重复序列;

三代测序(全基因组denovo)

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