宿主
1水貔藻疽，HIV多重感染超感染也是用来指个体被多种HIV病毒株感染的术语。已有报道个体可被HIV-l和H朐袁噙岿IV-2同时感染，但是感染发生的时间(例如，同时
还是继发)是一个重要的问题。是发生超感染还是双重感染需要有伴侣提供第二种病毒的证据。另外，在传播初期两种病毒都可能存在，但是直到晚期才会明显。在一个接受同时献血的婴儿中，发现了两种不同的HIV-1病毒株和重组病毒株。后者很可能反映了一个细胞的共感染。相反，在双重暴露的成人中，仅仅查出一种HIV-1型。这可能与相对的病毒载量或宿主对特定病毒株感染的敏感性不同有关。
在体内被一种以上HIV-1病毒株感染的情况还较少被报道或临床还很少见。然而，分子研究表明可能存在多种甚至可能达到3种不同HIV亚型的感染。在对HIV感染者的脾细胞研究中，观察到每个细胞内平均有3或4个前病毒，并且发现大量存在广泛基因变异的重组病毒的证据。这项证据提示，发生多病毒感染并且细胞被一个以上的病毒感染(能产生重组体)，很可能先于CD4的下调。然而，第二株或第三株病毒感染的时间和临床意义是关键问题。通常只有一种HIV-1型别占主导地位并影响致病过程；在同一个体感染的早期和晚期阶段，由PCR技术检测出的可能是优势毒株。
即使最初的感染与几种病毒分离株有关(例如，接受许多单位因子Ⅷ的受血者或多次输血)，以后常会出现一种优势HIV一1病毒株并且在病理过程中起主要作用。即使存在其他的病毒株，也可能被主要病毒株和(或)宿主免疫应答所抑制或清除。残留的不同病毒株最多成为病毒载量中很少的一部分，尤其是在淋巴结中如此。随着时间的推移，可以看到循环病毒的波动，很可能就像在其他HIV感染中观察到的那样反映了免疫选择。优势病毒株出现的机制尚不了解，但这可能反映了抗病毒免疫不能有效地识别病毒，或者被其他病毒株感染的细胞死亡而使替代的病毒型在更多的细胞中有效传播。
一些研究报告指出，个体首先被HIV-2感染与随后发生的抗HIV-1感染有关但对此问题尚有争论，并且这种现象也不常被见到。在对恒河猴的研究中发现了一些令人振奋的证据：血清阳转的猴能对第二次病毒的攻击产生保护。免疫反应好像起到很重要的作用。然而一份值得注意的报告称，恒河猴的SIV超感染再次激活了最初用来感染动物的HIV-2。HIV-2和SIV都存在，但动物却未发病。我们已经在狒狒先后被不同的HIV-2病毒感染的过程中观察到相似的现象。
2，超感染的流行目前，和其他病毒感染一样，超感染可以在体内发生，但是受到宿主免疫反应的影响(例如，不成熟或降低)。从感染者体内分离的PBMC中得到了被HIV感染，但是不产生病毒的CD4表达细胞。可见，这些代表了短期携带病毒的未活化、被CD8+细胞抑制了病毒复制的细胞或者含有潜伏期HIV的细胞。这些细胞可以在最初感染病毒被丢失或抑制或HIV产生之前被超感染。结果产生的子代病毒颗粒可能由混合表型的颗粒组成，甚至产生重组病毒。
病理报告表明，在初始感染后后可发生超感染，一些情况能影响这一过程。黑猩猩能被超感染，这些结果很可能反映了动物体内初始感染病毒的有限传播及随后受大剂量的第二种HIV病毒株和感染细胞等攻击的过程。然而，已经观察到黑猩猩可抵抗异种病毒的侵入。
最近，人体内发生超感染的可能也被越来越多地认知。在一项针对超过1OOO名静脉吸毒者(IVDU)的扩展研究中，跟踪了126名最近血清阳转的感染者，其中2O％被B亚型病毒感染，8O％被重组病毒E亚型感染。没有发现双重感染。1年以后，每1OO个人年发现有1，5％～3，9％的超感染发生，说明这个过程在HIV高危人群中并不是不常见。另外，感染的静脉吸毒者也是一个病人中出现瞬时超感染的证据。而且，研究报告感染者在初始感染期间以每年5％的速度流行。
在某些情况下，在初始感染期间血清阳转后不久可能发生超感染。可见，最初的免疫反应不足以阻止随后发生的感染。一个感染者在急性HIV感染后很早就进行了治疗，而随后仍发生了超感染，由此可以推断出免疫反应在阻止超感染方面的重要性。尽管有重要的CD8+T细胞抗病毒反应，但超感染病毒似乎能抵抗这种免疫反应。抗病毒治疗据说能减弱抗HIV免疫反应，可能会使个体对超感染更敏感。然而，一项对恒河猴进行的抗病毒治疗研究表明，在初期感染进行治疗能抵抗随后的异源病毒的攻击。
在喀麦隆的又一项研究发现了一些包括HIV一1亚型(A、C、D和E)和HIV一2亚型的混合感染。这些混合感染可能代表了共感染而不是超感染，但是强调了重组和发展新HIV毒株的特别的可能性。在最初被一个亚型感染的个体内发现了重组病毒，表明感染者中发生了细胞水平上的超感染，因为重组只能在细胞内发生。
一项针对l4对HIV血清型一致伴侣的研究结果与初期感染的发现相反，这些人面临再次感染的高度危险但未发现超感染。在对37个HIV感染的静脉吸毒者治疗后1～12年的治疗过程中取样研究有相似的发现。似乎与一个层次的抗超感染保护有关。而且，在一项对1718名感染者进行的研究中，在对107名个体进行观察的第一年未发现超感染。所有这些观察表明，超感染在慢性感染中不常见但可以发生在初次感染。