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用R包genetics做hardy weinberg检测

时间:2024-11-01 22:37:32

用R包genetics做hardyweinberg检测,自由度为1,显著性水平P小于0.01时,不满足hardyweinberg平衡。

工具/原料

电脑

R

方法/步骤

1、打开R,安装genetics包。依次输入下列内容install("genetics")library(genetics)

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2、输入数据,比如一对等位基因为A和G,在case组中基因型为AA、AG和G蘅荫酸圉G的人数分别为100,50和20个。mydata<-c(rep烫喇霰嘴("A/A",100),rep("A/G",50),rep("G/G",20))

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3、输入以下命令,进行hardyweinberg检测g1<-genotype(mydata)HWE.chisq(g1)

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